聚丙烯酰胺在自来水中主要用作发挥絮凝作用。自来水水源中含有悬浮颗粒、胶体等杂质。聚丙烯酰胺的分子量带有电荷，通过电荷中和与吸附架桥作用，能够将水中的微小颗粒聚集起来形成较大的絮体。例如；对于泥沙、藻类等悬浮杂质，聚丙烯酰胺可以使它们凝聚沉降，从而提高水的澄清度。
使用要求
类型选择：在自来水处理中，一般优先使用食品级的非离子聚丙烯酰胺。因为非离子聚丙烯酰胺受水质酸碱度和盐度的影响较小，并且食品级产品在安全性上更有保障。其在水中主要通过分子链的吸附作用来絮凝杂质，避免了因离子反应带来的水质变化。
纯度要求：用于自来水的聚丙烯酰胺必须具有高纯度。杂质含量；特别是有害物质（如残留的单体丙烯酰胺）的含量必须严格控制。因为残留的单体丙烯酰胺是一种有毒物质，对人体健康有害。国家标准规定，用于饮用水处理的聚丙烯酰胺中丙烯酰胺单体残留量应低于0.05%。
用量控制：在自来水处理中，聚丙烯酰胺的投加量必须控制。投加量过少，无法达到良好的絮凝效果，水的澄清度不能有效提高；投加量过多，不仅会增加处理成本，还导致水中残留过多的聚丙烯酰胺，对水质产生不良影响。聚丙烯酰胺在自来水处理中的投加量非常少，大约在每立方米水0.1-0.5毫克。
安全性保障
在使用聚丙烯酰胺处理自来水后，需要通过后续的检测手段来确保水质的安全， 除了对常规的水质指标（如浊度、PH值、微生物指标等）进行检测外，还需要特别关注聚丙烯酰胺带来的潜在风险。如丙烯酰胺单体的残留情况。只有在确保水质安全符合国家饮用水标准后，经过处理的水才能供应给用户。